Système d'acquisition, de gestion et d'analyse des données Dendrite ™

L'architecture classique d'un système d'électrophysiologie suit une structure à trois niveaux comprenant un amplificateur, une interface informatique et un logiciel d'acquisition de données.

Les systèmes d'amplificateurs patch clamp de Sutter Instrument, la famille IPA® et les systèmes d'amplificateurs dPatch® combinent ces trois niveaux dans des ensembles pratiques et entièrement intégrés qui incluent le logiciel d'acquisition, de gestion et d'analyse des données SutterPatch®, de plus en plus populaire. Le système Dendrite™ répond aux besoins des clients qui souhaitent combiner un amplificateur existant avec les fonctionnalités du logiciel SutterPatch.

Doté de huit signaux d'entrée analogiques, de quatre lignes de sortie analogiques et de huit sorties numériques, à un taux d'échantillonnage pouvant atteindre 50kHz, le système Dendrite couvre la majorité des applications d'électrophysiologie. Les convertisseurs A-N et D-A indépendants de 16 bits constituent une technologie de pointe qui évite la diaphonie et fournit une résolution adéquate pour pratiquement tous les scénarios d'utilisation. Des lignes d'entrée et de sortie de déclenchement permettent la coordination avec d'autres équipements.

La connexion à l'ordinateur est établie de manière pratique par une connexion USB 2.0 à haut débit et l'installation des pilotes et du logiciel SutterPatch se fait généralement en quelques minutes. Le système Dendrite accepte les entrées de la majorité des pinces à patch et autres amplificateurs d'électrophysiologie conformes à la norme commune de la gamme de signaux +/-10 V. Il contrôle également les amplificateurs et les périphériques. Il contrôle également les amplificateurs et les périphériques qui acceptent une entrée analogique ou numérique selon les normes communes.

LOGICIEL SUTTERPATCH

Le système logiciel Dendrite et SutterPatch a été conçu pour permettre à l'utilisateur d'ajouter des informations sur les réglages de l'instrument, l'application du stimulus et les paramètres externes de l'expérience et de les associer dans le temps aux traces des données brutes. Cela inclut tous les paramètres d'acquisition, ainsi que le timing et la progression de l'expérience. En outre, l'expérimentateur peut déclencher manuellement des balises pour documenter des événements tels que l'application d'un stimulus dans des instruments non connectés au système Dendrite.

Des informations sur les paramètres environnementaux et une spécification plus détaillée des propriétés de l'échantillon peuvent être enregistrées et stockées avec les données brutes. Au total, plus de 600 attributs de métadonnées sont pris en charge. Par exemple : l'espèce animale, le génotype, la date et l'heure de préparation d'un échantillon de cellules, les solutions d'enregistrement, la résistance de la pipette, les propriétés du matériel et des informations détaillées sur les stimuli appliqués.

VISUALISATION ET ANALYSE DES DONNÉES

Le logiciel SutterPatch a été conçu pour simplifier la navigation et l'analyse d'ensembles de données complexes. La fenêtre de visualisation prend en charge plusieurs modes d'affichage en deux dimensions et un affichage tridimensionnel innovant. La vue en 3D est particulièrement utile lors du développement des essais. Construit sur la dernière version de la plateforme Igor Pro, SutterPatch combine les fonctionnalités natives d'Igor Pro avec une multitude de caractéristiques adaptées aux applications d'électrophysiologie. Tant le nouveau venu que l'utilisateur expérimenté de programmes de patch clamp se sentiront à l'aise avec le logiciel SutterPatch.

Acquisition de données

• Une connexion USB haute vitesse contrôle l'acquisition des données
• Jusqu'à 8 canaux d'entrée analogiques (±10 V ; taux d'échantillonnage de 0,1-50 kHz par canal)
• 4 canaux de sortie analogiques (±10 V)
• 8 canaux de sortie numérique (TTL)
• Taux d'échantillonnage global jusqu'à 400 kHz
• Formes d'onde de commande complexes
• L'acquisition de données peut être lancée par une horloge microseconde intégrée ou un déclencheur externe (TTL).

Logiciel SutterPatch

• Construit sur la base de Igor Pro (WaveMetrics, Inc.)
• Les paradigmes et les routines permettent un contrôle expérimental complet.
• L'éditeur de formes d'onde permet de créer facilement des modèles de stimulus, même les plus complexes, ou des modèles définis par l'utilisateur.
• Les métadonnées associées stockent toutes les informations pertinentes concernant votre expérience.
• Des routines complètes d'analyse des données et des graphiques de qualité professionnelle.
• Réduction en ligne de la fréquence de ligne à réponse rapide
• Fonctionne sous Windows 10 ou ultérieur (64 bits),ou Macintosh OS X 10.11 (El Capitan).

Les modules d'application fournissent une fonctionnalité ciblée pour des applications particulières.

• Module de détection d'événements : Un algorithme de déconvolution qui excelle dans la détection d'événements synaptiques miniatures, même sur un fond bruyant.
• Module d'analyse du potentiel d'action : Tracé du plan de phase, statistiques de synchronisation et de forme d'onde
• Module caméra : Un moyen facile de documenter l'identité et l'état de la cellule enregistrée.
• Module d'analyse monocanal : Histogramme de tous les points, trace idéalisée, distribution de la durée et de l'amplitude et nuage de points.